Em 2009, a violência extrema continuou a devastar o leste da RDC. Mulheres, crianças e até homens foram violentados, centenas de milhares de pessoas tiveram de abandonar suas casas e outras centenas morreram. Apesar da violência, MSF continuou a trabalhar com clínicas móveis, campanhas de vacinação, tratamento de cólera, distribuição de itens de ajuda humanitária, programas hospitalares e tratamento para vítimas de violência sexual e a combater epidemias de ebola e sarampo. Ao longo do ano, MSF vacinou mais de 500 mil pessoas contra o sarampo. No leste do Congo, MSF realizou 14 cirurgias de emergência por dia, 530 mil consultas médicas, tratou 10 mil crianças desnutridas, 5 mil pacientes de cólera e ofereceu cuidados de saúde a 5 mil sobreviventes de estupros.